Dünya’ya herhangi bir zarar gelmeden durdurmayı başardıkları uzay gemisi nihayetinde düzene girmeyi başarmıştır. Atılgan ismini verdikleri Dünya’nın en büyük uzay gemisi artık hiç kimseye zarar vermeden, önüne çıkanları ezip geçmeden kendi rotasında ilerlemektedir. Emekli Amiral Kirk ve onun yetiştirmiş olduğu ekibi ezeli düşmanları olan Khan’ı sonunda yok etmeyi başarmışlardır. Ezeli düşmanları olan Khan’ı yok ederlerken Mr Spock kendi hayatını feda etmiştir. Doktor McCoy çaresiz bir hastalığa yakalanmıştır. Dünya’nın en büyük uzay gemisi, Yıldız Gemisi Atılgan Spock’ın cesedini almak üzere son bir kez Genesis gezegenine doğru yola çıkar.
